然而唐骏并没有安于现状，他发现公司的开发的流程中存在着巨大的漏洞，导致工作效率低下，唐骏决心要改变这种状态，他利用业余时间重新设计了软件框架，经过几个月的努力，他把成果拿到老板面前，唐骏的新方案被微软接纳，原来需要300个人的工作团队被压缩为仅需要十余人就可以胜任。唐骏一战成名，入职一年后，就成为了开发经理。
1997年，微软开始考虑在中国市场发力，此时的唐骏已经是微软高级开发经理了，他得知微软在中国的计划后，主动向比尔盖茨提出，他要回到中国，帮助微软开拓中国市场。很快，唐骏带着任务回到中国，在上海开始筹建微软大中华区技术支持中心。仅仅4年后，该中心就在唐骏的领导下升级为微软全球技术中心。2002年，唐骏出任微软中国区总裁，年薪上千万，他完成了从程序员到总裁的传奇转身。
2004年2月，唐骏离任微软中国总裁的职位，他被授予“微软终身荣誉总裁”，在离开时，微软创始人比尔盖茨对他说：“Jun，感谢你为微软做出的巨大贡献，微软永远是你的家，随时欢迎你回来。”微软目前是一家有着近9000亿市值的科技巨头，可以说，唐骏为微软在中国乃至亚洲的开疆拓土立下了赫赫功劳。
唐骏的管理之道
唐骏在企业管理上有着自己独到的见解。他说：目前中国顶尖的100家民企里，过几年只会剩下20家， 而其中被淘汰的都是因为管理出了问题。唐骏在担任微软中国的总裁时，坚持亲自面试每一个进入公司的人，据估算，唐骏亲自面试过超过2500人，他通过这种方式，表达自己对于每个员工的重视，同时也表现出公司对人才的尊重。唐骏认为，中国员工不仅看重金钱报酬，还十分看重工作的感觉，所以唐骏非常注重让员工有自豪感和满足感。